目前常用的网站入侵方法有五种：上传漏洞、暴库、注入、旁注、COOKIE诈骗。
1、上传漏洞：利用上传漏洞可以直接得到Web shell，危害等级超级高，现在的入侵中上传漏洞也是常见的漏洞。
2、暴库：暴库就是提交字符得到数据库文件，得到了数据库文件我们就直接有了站点的前台或者后台的权限。
3.注入漏洞：这个漏洞是现在应用最广泛，杀伤力也很大的漏洞，可以说微软的官方网站也存在着注入漏洞;注入漏洞是因为字符过滤不严谨所造成的，可以得到管理员的账号密码等相关资料。
4、旁注：找到和这个站同一服务器的站点，然后在利用这个站点进行提权，嗅探等方法来入侵我们要入侵的站点。
5、COOKIE诈骗：COOKIE是上网时由网站所为你发送的值记录了你的一些资料，比如说：IP、姓名等。
嗯....不知道你要干什么，希望你不要干坏事。
第一步：情报收集与分析
用扫面器或者人工的对服务器的状态进行探知，获得以下信息： 服务器类型（大致分为windows服务器和linux服务器）、服务器版本、服务器的网络布局（自己与网站服务器的相对网络位置，是否有防火墙，不过现在的服务器一般都在防火墙后面）、服务器上开启的端口号、服务器上运行的服务及其版本、网站的网页脚本类型、脚本版本等等。最后根据以上信息判断该服务器可能存在的漏洞，这将是下一步的基础。
第二步：攻击开始
根据上一步收集到的漏洞信息开始对网站服务器发动攻击。一般是登陆服务器上开启的服务并猜测该服务的密码（弱口令攻击，现在基本失效）如果猜对便可以根据服务获得相应的服务器操作权限，如果运气好，这里就可以直接拿下服务器。或者根据服务器上运行的服务所存在的溢出漏洞进行溢出攻击（不过，溢出漏洞并不好找）。或者跟据网页脚本上的漏洞进行网页渗透。
第二步的主要目的就是为了获得一个可以在目标服务器上执行一定命令的权限，这也是最难的一步。
第三步：权限提升
如果只是为了从服务器上拿些东西，或者修改服务器上的一些文件，利用第二步获得权限可能已经足够，但是如果遇到细心的管理员进行了严格的权限管理，或者想完全控制服务器还需要提权操作。也就是利用第二步获得的权限获得跟高的服务器使用权限的操纵。其实现方法根据不同的入侵路径，会很多。这里只提一下大概思路，windows服务器：获得服务器系统盘的读写权（有时可以跳过）、获得system权限、建立自己的隐藏管理员用户、留下后门或木马。linux：获得root权限、留下后门。
最后就是清理自己的脚步，删除或者修改服务器上的日志文件，不然管理员会很容易察觉到被入侵。
网站入侵的形式其实很多，上面只是较为常用的形式而已。其他的还有 中间人攻击 社会工程学攻击等等。
以上只是个人的见解，希望能帮到你......
以上的答案都胡扯..
我先介绍我以前刚入门的方法
1.先找个工具如啊D从它的浏览器里批量找有注入漏洞的网站
2.顺着这个注入漏洞找出后台密码
3.找后台地址
4.进后台
5.找可以利用的地方(如上传漏洞.数据库备份)主要是插入一句话木马.
6.连接刚写的一句话木马地址
7.写马.
8.成功拿到webshell!
如果要更深一点的话就是服务器提权了!
这个就不在你的问题之内了!
目前我所了解的没有那么多 大概有十几种：跨站、上传漏洞、注入、爆破（数据库）、爆破（服务器，前提是开启远程）、ASP脚本错误（极少数发生）、还有就是靠社会工程学了，现在漏洞越来越少，心理战术越来越实用！
首先，观察指定网站。
入侵指定网站是需要条件的：
要先观察这个网站是动态还是静态的。
如果是静态的（.htm或html）,一般是不会成功的。
如果要入侵的目标网站是动态的，就可以利用动态网站的漏洞进行入侵。
Quote:以下是入侵网站常用方法：
1.上传漏洞如果看到:选择你要上传的文件 [重新上传]或者出现“请登陆后使用”，80%就有漏洞了！
有时上传不一定会成功,这是因为Cookies不一样.我们就要用WSockExpert取得Cookies.再用DOMAIN上传.
2.注入漏洞字符过滤不严造成的
3.暴库:把二级目录中间的/换成%5c
4.’or’=’or’这是一个可以连接SQL的语名句.可以直接进入后台。我收集了一下。类似的还有：
’or’’=’ " or "a"="a ’) or (’a’=’a ") or ("a"="a or 1=1-- ’ or ’a’=’a
5.社会工程学。这个我们都知道吧。就是猜解。
6.写入ASP格式数据库。就是一句话木马〈%execute request("value")%〉 （数据库必需得是ASP或ASA的后缀）
比如：默认数据库，默认后台地址，默认管理员帐号密码等
8.默认数据库/webshell路径利用:这样的网站很多/利人别人的WEBSHELL.
/Databackup/dvbbs7.MDB
/bbs/Databackup/dvbbs7.MDB
/bbs/Data/dvbbs7.MDB
/data/dvbbs7.mdb
/bbs/diy.asp/diy.asp/bbs/cmd.asp
/bbs/cmd.exe
/bbs/s-u.exe
工具：网站猎手 挖掘鸡 明小子
黑客入侵网站的思路其实跟我们的思路都是差不多的。首先从简单的入手，如果简单方式攻破了，自然不想花费太多时间去研究，黑客也是希望多花点时间挑战高难度的网站。
那么一般黑客先从哪里入手：
第一：网站后台，应该现在很多网站都是套用开源系统开放，所以网站后台地址很容易ping出来。大多都是admin、manage。所以，网站后台密码不要过于简单，很多管理员方便记住密码，大都是admin123。这样的网站，要把网站搞废，分分钟的事情。
第二：网站后台攻破不了的话，从数据库入手。由于服务器IP很容易PING出来，很多人数据地址都是采用物理数据库地址。那么就差数据库密码了。所以，如果网站数据库架设不严谨，考虑不周全，那么数据库同样也是简单的被攻破。
所以，做网站一定要找有经验的团队。
我来说两句