电影里说,机器用死去的人喂养活人,人体本身就是能量.这样的话,机器取走人的能量会造成人类使用的营养一代不如一代.(学学化学的反应能量就知道了)
用太阳能的角度解释,人类的能量来自于太阳能,人就是在战争以前的贮存下来的太阳能,机器是从人类那里取出太阳能.对人类的影响就是体质一代不如一代.(人类的能量来自于营养,营养可被反复使用,这楼主应该知道.营养被使用造成的后果只不过是数量减少,致使人类体质变差)一旦用光了人类,机器自然会用核能的.(根据电影,机器应该已经使用核能了)
原创回答：
答案比较长，不知道楼主有没有这个耐心。
黑客帝国发生在22世纪末的时候，所以也有翻译“22世纪杀人网络”。
在那个时候，机器人的发达，使得它想代替人类，于是终于发生了一场大站。人们以为那些靠太阳能支持的机器，只要没了阳光就完了，于是用核武遮蔽了天空。可是遗憾的是，机器很快找到了新的能源的来源——人类。
第一集中，墨菲斯向尼奥讲述过这个问题，人体每时每刻都在制造生物电，于是机器就想办法把人当作电池来使用。这也是为什么第一集里，尼奥坐进崔妮蒂的车的时候，前排副驾驶位置上的(那个白头发女的叫什么来着？)转身拿枪对着他，命令他脱掉衬衫，还叫他copper head(中文字幕没翻译这个词，或者翻译得更直接)，copper head在美国英语中，是“金霸王”电池的外号。这时候的尼奥还接驳在母体(the matrix)中，也就是说，他正在为母体供电呢。
为了让人一辈子给它们做电池，母体给他们的大脑中传输幻像，好象自己在学习、工作、生活，但实际上，他们接收到的所有信息都是电脑干扰大脑神经而获得的，并没有真正吃到什么、喝到什么以及干什么。他们所经历的，都是电脑告诉他们的内容。
而墨菲斯他们都是被解放出来的人类，当然，核武战争之后，还有少部分人类转入地下生活，在很深的地底靠近地核的地方，温度还是比较高的，人们可以在那里生活，那里就成了他们的锡安。墨菲斯他们又在不断的解放被“养殖”的人类，一来扩大自己的力量，二来寻找墨菲斯深信的“救世主”。
再来解释一下母体控制人的方式，说到底，其实就是给他们营造一个虚拟的世界，就像是现下很流行的网络游戏一样，每个人在这游戏世界中担任一个角色，按游戏给你设定的规则，在里面“生活”。
而被救出来的人类，就可以通过一些方式黑到网游中去，就象我们玩网游的时候用外挂一样。因此游戏里面有网管，可以随便把人踢走、删号；母体里面有探员，可以随便把人杀掉。而这些探员可以象网管一样，爱用哪个帐号登录就用哪个帐号登录，探员可以负在任何人的身体上执行任务。
解释这么些，楼主该清楚黑客帝国是什么意思了吧。
所以Reload中Neo对Architect说，你们不能离开人类生存。Architect回答，我们已经准备承受一定的损失。间接证明了Machine World运作的能源其实并非来自人类，也就是否认了Matrix中Zion人自以为机器人养殖人类的理论基础。以人类的生物能作为能源，可能优越于其他的生物，因为人类对能源的利用率较高，但这不是根本原因。所以我假设，Matrix是为了机器自身进化而建造的实验场所，Architect孜孜不倦地修改Matrix研究人类心理以借鉴人类独有的创造能力，以完成机器世界的独立进化。
为什么黑客帝国里面的电脑不会用化学能或者核能发电
人体发电，本身就是这个故事的BUG啊，到现在没弄懂人体从哪得到的能量。故事而已，情节需要，不要太较真。推荐去看一看动画版，没有了基哥耍酷的镜头，情节更清晰，个人觉得更好一些。
机器的真实目的是要观察人类的世界，了解人类的感情与理性，而机器没有感情只有逻辑，所以他们要靠观察人来自我进化，到了尼奥这里他们已经是第六次进化了。
听说黑客帝国中人体热能只是核能的启动能源,并不是主要能源……
我来说两句